Crkva se protivi potpisivanju arbitražnog sporazuma između Hrvatske i Slovenije te apelira na hrvatsku Vladu da od njega odustane pa čak i pod cijenu neulaska u EU ili nastavka blokade, piše u pismu Komisije biskupske konferencije. U pismu također piše da hrvatski građani ne žele ući u EU ako ona ne dokaže da je zajednica prava i moralnih vrijednosti. Komisija također misli da se Hrvatska mora djelatnije i energičnije suprotstaviti nepravdi slovenskih presizanja jer ona ugrožavaju pravdu i mir i pridonose destabilizaciji europskoga jugoistoka. Smeta joj i što je Hrvatska odustala od načela da o graničnom sporu odlučuje Međunarodni sud pravde UN-a, a ne nekakav "arbiražni sud" neizvjesna sastava i pravnog iskustva. Naglašavaju i da Vlada krši Konvenciju UN-a o pravu mora i ustupa Sloveniji nešto što to pravo zabranjuje, a to je moguće proširenje njezinog teritorija mora na hrvatsko more. Komisija smatra i da Slovenija već ima izlaz na otvoreno more, ali kroz talijanske teritorijalne vode.