Viša inspektorica Ministarstva financija Marija Grbić-Padjen u proljeće 2012. godine dovršila je zapisnik o proračunskom nadzoru u Ministarstvu znanosti, obrazovanja i sporta, doznaje Jutarnji list. Provjeravala je prve projekte za koje je Hrvatska trebala povući sredstva iz EU fondova. 

Prema obavljenom nadzoru vidi se da je projekt kampusa u Zagrebu vrijedan oko 800 milijuna eura, a kampusa u Rijeci oko 24 milijuna eura. Rektori Sveučilišta u Zagrebu i Rijeci, Aleksa Bjeliš i Pero Lučin javno su se sukobili oko toga kome je prvo potreban novac netom prije nadzora. Ministarstvo je zaključilo da je to Rijeka i prijavilo ga kao veliki projekt jer su na vrijeme dovršili pravnu dokumentaciju. 

Međutim, u zapisniku stoji da 'prepiska oko projekata između službenika Ministarstva znanosti i dvaju Sveučilišta neuredna do nerazumljivosti pa prema tome protivna Zakonu o općem upravnom postupku'. 

Ministarstvo je platilo 2700 eura konzultantsku kuću iz Novog Sada, koja je bila tehnička podrška riječkom Sveučilištu. Nadzor je zaključio da se tako moglo pomoći i Zagrebu. Tada je počela prepiska Jovanovića i Šegona (tadašnjeg Linićevog pomoćnika). Jovanović je uvjeravao kako je riječko Sveučilište najspremnije za financiranje, a zatim i da ljudi nisu imali iskustva u pripremanju dokumentacije za EU. Šegon mu je proslijedio osam odbijenica.

Nadzor na kraju nije mogao zaključiti je li poštovana odredba Sporazuma potpisanog između Vlade Republike Hrvatske i Europske komisije.

Ministarstvo znanosti tvrdi da nisu pogodovali Rijeci. Činjenica je da su oni odradili posao, a Zagreb nije. Ipak, priznali su da je bilo aljkavosti u poslu.